EM adalah kultur campuran dari mikroorganisme yang menguntungkan bagi pertumbuhan tanaman. Sebagian besar mengandung mikroorganisme Lactobacillus sp. bakteria penghasil asid laktik, serta dalam jumlah sedikit bakteria fotosintetik Streptomyces sp. dan ragi. EM mampu meningkatkan dekomposisi limbah dan sampah organic sehingga sangat bagus digunakan untuk mempercepat pengomposan sampah organik atau kotoran haiwan, meningkatkan ketersediaan nutrisi tanaman serta menekan aktiviti serangga hama dan mikroorganisme pathogen.
Tanah regenerasi atau yang mengandungi banyak bakteria berfaedah menyumbang kepada perkembangan tumbuhan, kesihatan, hasil yang tinggi serta bebas penyakit dan serangga.Tanah tetap menjadi sihat tanpa perlunya tambahan bahan kimia pertanian. Sebaliknya berlaku apabila tanah di dominasi oleh bakteria patogen ataupun degenerasi. Dalam kes ini, keseimbangan mikroflora tanah tidak stabil dan bakteria yang menyebabkan penyakit mengambil alih ekosistem tanah
EM diaplikasi sebagai inokulan untuk meningkatkan keragaman dan populasi mikroorganisme di dalam tanah dan tanaman, yang selanjutnya dapat meningkatkan kesehatan, pertumbuhan, kuantiti dan kualiti produksi tanaman secara berkelanjutan. EM tidak mengandung mikroorganisme yang secara genetic telah domodifikasi tetapi terbuat dari kultur campuran berbagai spesies yang terdapat dalam lingkungan alam.
EM digunakan dalam rawatan air dapat memperbaiki kualiti dan persekitaran air .Melalui proses penapaian (fermentation) ia akan mengikat nutrien dari diambil oleh species lain seperti algae contohnya,mengurangkan mendapan(sludge) dan ammonia, meningkatkan kebolehlarutan oksigen(DO) dan turbiditi.
photosynthetic bacteria (PSBs) di dalam larutan EM adalah bakteria semulajadi yang mempurifikasi (purifying microorganisms). Terdapat lebih daripada 6 klafikasi PSBs dan hanya satu spesifik kumpulan yang bertindak secara effektif dalam proses purifikasi air. Kumpulan bakteria purple non-sulfur photosynthetic bacteria didalam larutan EM adalah kumpulan utama yang digunakan sebagai agen purifikasi air (rawatan air) dan juga dalam akuakultur.
